眼睛瞳孔颜色不一样可能由多种原因引起，如虹膜色素异常、眼部疾病、遗传因素、外伤以及某些全身性疾病等。
1. 虹膜色素异常：虹膜中色素的分布和含量不同，可能导致瞳孔颜色出现差异。这可能是先天形成的，也可能是后天由于环境、药物等因素影响。
2. 眼部疾病：某些眼部疾病如虹膜睫状体炎、虹膜萎缩等，会影响虹膜的结构和色素分布，从而导致瞳孔颜色改变。
3. 遗传因素：部分人天生就存在瞳孔颜色不一致的情况，这与家族遗传有关。
4. 外伤：眼部受到严重的外伤，损伤了虹膜组织，可能引起瞳孔颜色变化。
5. 全身性疾病：某些全身性疾病如白化病、瓦登伯格综合征等，可能会累及眼部，导致瞳孔颜色异常。
6. 药物影响：长期使用某些药物，可能对虹膜产生影响，进而改变瞳孔颜色。
总之，眼睛瞳孔颜色不一样可能是多种因素综合作用的结果。如果发现瞳孔颜色异常，应及时到正规医院的眼科就诊，进行详细的检查和诊断，以便确定具体原因，并采取相应的治疗措施。